El 14 de diciembre de 1591 moría San Juan de la Cruz cuando contaba con apenas 49 años. San Juan y Santa Teresa iniciaron la reforma del Carmelo, fundando el primer convento de carmelitas descalzos.
Dios le concedió una cualidad especial: la de saber enseñar el método para llegar a la santidad. Y eso que enseñaba de palabra a personas que dirigía, lo fue escribiendo y resultaron unos libros tan importantes que le han conseguido que el Sumo Pontífice lo haya declarado Doctor de la Iglesia. Algunos de sus libros más famosos son: «La subida del Monte Carmelo», y «La noche oscura del alma».
Como poeta ha sido admirado por siglos a causa de la musicalidad de sus poesías y de la belleza de sus versos. Es muy popular su «Cántico Espiritual».